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  • GWAS和EWAS检测的不二之选

    作为GWAS和EWAS研究领域最主流的检测平台iScan,覆盖80%以上的研究团队所应用,更加有利于多中心的数据整合应用,使得超大样本群体、多中心验证、人群异质性等成为可能,充分发挥GWAS和EWAS芯片的研究价值。iScan系统具备高性能的光学系统及核心专利芯片设计原理,此外illumina不断推出独特的、针对性的、多物种丰富GWAS芯片,比如广受好评的针对中国人群的中华芯片,廉价的东亚人群的ASA芯片等,保障了不同科研项目的特定需求。在EWAS方面更是独领风骚,其850K芯片在该研究领域基本一枝独秀。

    技术原理

    GWAS芯片技术原理:采用Infinium技术,检测中采用全基因组扩增方式,无需PCR反应,不依赖限制性内切酶,SNP位点的选择上可以完全根据基因组情况来选择;gDNA样品在芯片杂交后通过等位基因特异性的单碱基延伸来完成,确保高质量的实验数据。Illumina Infinium基因分型技术包括全基因组SNP芯片和iSelect自定义全基因组SNP芯片。


    EWAS芯片技术原理:850K芯片沿承了Illumina应用在450K芯片中经典的BeadArray技术,通过Infinium I及II探针设计,在对目标区域全面覆盖的同时也保证数据稳定可靠。Infinium I的设计是通过两种不同的探针的信号值来区分甲基化的CpG位点(C)和非甲基化的CpG位点(T)的比例;而在Infinium II的设计中,每个检测位点只设计一个探针,通过比较该探针掺入的两种荧光的信号值来计算目的位点的甲基化比例。





    技术优势


    最高的质量,无限的应用
    让革命性的高精度扫描仪来助力您的研究,它支持广阔的芯片应用,可开启无限探索的潜能。iScan系统支持Illumina广泛的遗传分析组合,适用于基因分型、CNV分析、DNA甲基化和基因表达谱分析。


    创新的成像系统
    HiScan和iScan系统使用高性能的激光器、光学和检测系统,带来亚微米的分辨率和无以伦比的通量。其结果是扫描时间大大缩短,而不牺牲数据质量和重复性。iScan系统具有高信噪比、高灵敏度,检测极限低,动态范围广,产生了出色的数据质量,适用于生物标志物筛查(如农业基因组学筛查)或任何验证研究(如验证复杂疾病的研究)。


    灵活可扩展的系统
    HiScan系统支持Illumina广泛的遗传分析组合,适用于基因分型、CNV分析、DNA甲基化和基因表达谱分析。液体处理机械臂和Autoloader 2.x让分析处理自动化,可以缩短手工操作的时间,实现每天24小时的扫描。扫描仪和组件是模块化的,形成了一个可调的系统,让其可根据各种通量水平来配置。



    应用方向


    GWAS芯片技术服务

    中华芯片技术服务

    ASA芯片技术服务

    人全基因组DNA甲基化芯片技术服务

    850K芯片技术服务



  • SNP分型和DNA甲基化金标准

    Massarray是基于飞行时间质谱仪器进行的基因检测系统平台,是基因检测领域中唯一采用分子量进行基因检测的技术,具有高准确性的显著特点,在科研领域中,其SNP分型和DNA甲基化均为公认的金标准技术,成为GWAS和EWAS的黄金搭档。在临床及大健康基因检测领域中,耳聋基因检测、HPV基因检测、个体化用药基因检测、疾病易感基因检测、肿瘤液体活检等均有广泛的应用,成为精准医学重要的技术平台之一。
    博淼生物作为Massarray技术国内最大的技术服务商,在科研和医学产品转化方面,均具有拥有丰富的技术经

    技术原理

    SNP分型原理:系统主要是利用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS) 进行分析,即PCR扩增产物或者预处理样本在延伸单碱基后,将制备的样品分析物与芯片基质共结晶,将该晶体放入质谱仪的真空管,而后用瞬时纳秒 (10-9s) 强激光激发, 由于基质分子经辐射所吸收的能量,导致能量蓄积并迅速产热,从而使基质晶体升华,核酸分子就会解吸附并转变为亚稳态离子,产生的离子多为单电荷离子,这些单电荷离子在加速电场中获得相同的动能,进而在一非电场漂移区内按照其质荷比率得以分离,在空小管中飞行到达检测器。


    候选DNA甲基化位点CpG site定量: 将待测DNA经过亚硫酸盐处理,DNA中未甲基化胞嘧啶(C)转变为尿嘧啶(U),而甲基化修饰的胞嘧啶不变;通过PCR扩增过程引入T7-启动子序列,经T7 DNA聚合酶的体外转录过程得到各样本RNA产物;经过碱基特异性酶切处理,得到RNA小片段,并用飞行质谱检测每个片段的分子量,最后 EpiTYPER程序完成数据的自动化处理并报告每个检测片段的甲基化程度。


    技术优势

    SNP分型优势:

    高通量:一张芯片可对384个样本进行多重检测,每个体系理论可最高实现60重反应,通量可根据客户要求进行个性化调整

    高性价比:无需荧光标记,仅需合成普通引物,大大降低成本;单个样本分析成本低

    适用范围广:几十到成千上万个样本,同时检测几十到成百上千个位点

    高灵敏度:分析所需样本量少(10ng)

    高灵活度:一张芯片上样本数量和位置可随意选择;一张芯片上样本和位点检测匹配可随意选择

    候选DNA甲基化位点CpG site定量:

    高灵敏度:可发现低至5%甲基化修饰,样本起始量低至10 ng。
    重复性好:CV≤5%。
    高性价比:用384孔板进行 PCR 反应,一个扩增产物可以进行多重 CpG位点分析,数据无需后续验证,可直接发表结果。单片段最长可检测500bp。

    应用方向

    Massarray SNP技术服务

    Massarray 靶向DNA甲基化技术服务

  • 单细胞研究革命性平台

    10X Genomics ChromiumTM系统支持全面的基因组学和高通量的单细胞转录组学研究。利用现有的测序系统和工作流程,有效解决了组织样本无法破解的细胞异质性难题,有助于发现新的细胞类型;并基于大量的单细胞基因表达数据,可进行细胞表达特征聚类、亚群表达特征分析、标志物筛选等方面的研究,在生殖、免疫、干细胞分化、肿瘤异质性、神经系统发育以及脑发育等研究领域中有着广泛的应用。
    博淼生物拥有两台10X Genomics平台,可灵活高效提供相关单细胞学研究技术服务,在前期方案设计、不同样

    技术原理

    单细胞转录组测序:每个油滴包含Gel bead、RT-PCR反应液、单细胞。该系统的核心是Gel bead,单细胞建库共有75万种Gel bead,每种Gel bead上长有数百万条相同的序列,也就是相同的barcode,在得到乳浊液之后,接下来把细胞膜破掉,让细胞当中的mRNA游离出来。游离出来的mRNA与小液滴中的水相混合,也就是和逆转录酶、结合在凝胶微珠上的核酸引物、以及dNTP底物相接触。接着,发生逆转录反应。mRNA与凝胶微珠上带标签的DNA分子相结合,在逆转录酶的作用下,逆转录出cDNA来。这样得到的cDNA分子是带有这个微珠所特有的Barcode标签的,并且每个cDNA分子各自还会带有特定的UMI标签。然后按照illumina建库步骤进行文库的构建、 illumina测序仪上机测序、生信分析。


    单细胞免疫组库测序: 10X Genomics单细胞免疫组库测序是建立在GemCode技术上的微流体平台,将带有条形码和引物的凝胶珠与单个细胞包裹在油滴中;接下来在每个油滴内,凝胶珠溶解,细胞裂解释放mRNA,通过逆转录产生用于测序的带条形码的cDNA。液体油层破坏后,cDNA一分为二,后续同时进行基因表达和免疫组库文库构建;其中TCR或者BCR的V(D)J序列通过设计在TCR或者BCR、lg的C区域的巢式PCR引物进行富集。然后使用Illumina测序平台对文库进行测序检测,即可一次性获得大量单细胞的基因表达和免疫组库数据,实现在单细胞水平同时对基因表达和免疫组库进行研究。



    单细胞ATAC测序:全名为Assayfor Transposase Accessible Chromatin with high-throughput sequencing(染色质易开放区域测序),针对开放染色质区域进行测序,从而研究该区域特有的转录调控机制,具体为利用Tn5转座酶切割染色质的开放区域,并加上测序引物进行高通量测序,通过生物信息分析鉴定转录因子结合位点和核小体区域位置。

     

    单细胞CNV测序: 10X单细胞CNV检测技术与以往检测技术不同,是通过两步捕获步骤,并使用Gelbeads将每个细胞标记上特有的barcode,从而在上千个单细胞的水平检测基因拷贝数变化,且能检出低至1%的罕见克隆。单细胞CNV可使用冻存组织样本进行实验,大大提高了应用的适用范围。



    技术优势

    Ø 高通量:单个样本细胞检测数最高可达100-10000,一次性可上机8个样本

    Ø <7分钟时间内捕获100-80,000个细胞

    Ø 对更小的细胞没有限制

    Ø 项目周期短一天内即完成从细胞悬液到cDNA文库构建所有的测序准备工作

    Ø 胞捕获效率高:单个细胞捕获效率高达65%,可准确鉴别稀有细胞类型

    Ø double rate:1000个细胞0.9%
    Ø Illmuina测序系统的兼容:兼容Illumina® HiSeq®4000/2500/NextSeq®/MiSeq® 测序系统

    应用方向

    单细胞转录组测序

    单细胞免疫组库测序

    单细胞ATAC测序

    单细胞CNV测序

  • 基因芯片技术的灯塔

    Agilent公司专利的喷点式原位合成技术(SurePrint技术),为您快速提供超高精准度(99%)长链(-60mer)载玻片式芯片。生产的60-mer寡核苷酸阵列比短寡核苷酸阵列检测灵敏度高八倍。其全自动进样、自动聚焦的双激光同步扫描仪,为您提供可靠的数据和谱图。Agilent-GeneSpring软件是目前应用最广泛的基因芯片数据分析软件,功能强大,界面友好,可以使您快速具备独立分析基因芯片数据的能力,从海量的芯片数据中轻松解脱出来。
    基因芯片服务作为博淼生物的传统优势项目,一直以来聚焦采

    技术原理

    双色荧光标记表达谱芯片的基本原理就是,用两种不同的荧光分别标记实验组和对照组扩增后的cRNA,调整好两组的杂交用量,然后与表达谱芯片杂交,通过扫描芯片上两种荧光(红、绿)的相对强度比率,两组RNA有差异的部分会出现颜色偏移,从而计算出相应基因表达量是上调还是下调。如果选择做单色荧光标记的表达谱芯片检测,只需用一种荧光标记一个样本进行杂交即可。


    技术优势


    1.独特的SurePrint原位合成技术:SurePrint技术依靠强大的探针设计运算法则和准确的确认方法,无需“光掩膜”,并利用工业规模的喷墨打印技术和独特的质控程序来合成芯片。正因为有了这项技术,安捷伦的芯片制造产业也得到蓬勃发展。

    2.双色芯片检测:可以根据客户的需要,将相互比较的两个样本分别用不同的荧光标记,杂交在同一张芯片上。相较于到传统的单色芯片检测,此方法可以发现更微小的表达差异,并有效地控制实验的批次差异。

    3.用量少:只需200ng 总RNA即可用来进行标记实验(不包括质检所消耗的量),大大降低了RNA抽提的难度,能让客户利用剩下的总RNA进行验证。

    4.灵活方便的定制服务:安捷伦公司除了提供成品芯片外,还开放了一个免费的芯片设计平台,让客户可以根据自己的需求设计专有的芯片,同时亦可让客户分享其他客户的定制芯片,满足客户不同的研究需要。



    应用方向


    CNV芯片技术服务

    lncRNA芯片技术服务

    miRNA芯片技术服务

    mRNA芯片技术服务



  • 更高的通量、更长的读长、更快的速度

    作为Illumina公司经典高通量测序系统Hiseq系列中的代表平台,HiSeq4000系统融合了行业领先的 SBS 技术和创新的有序流动槽技术, 带来了最高的单日通量, 最快的运行时间和每个样品最低的成本, 适合更广泛的应用。
    HiSeq4000系统的每个流动槽在3.5天内可产生>750Gb的数据。双流动槽的HiSeq4000系统(图1)具有最高的单日测序通量和每个样品的最低价格,适合最广泛的应用。HiSeq4000系统每天可产生>400Gb测序数据,每次运行通量高达1.5Tb。

    技术原理

    Illumina测序采用边合成边测序技术(Sequencing by sythesis,SBS):

    (1)建库:在DNA片段两端加上序列已知的通用接头构建文库,文库加载到测序芯片Flowcell

    (2)簇生成。文库两端的已知序列与Flowcell基底上的Oligo序列互补,每条文库片段都经过桥式PCR扩增形成一个簇

    (3)簇扩增及测序。与步骤二同时进行。即在碱基延伸过程中,每个循环反应只能延伸一个正确互补的碱基,根据四种不同的荧光信号确认碱基种类,保证最终的核酸序列质量,经过多个循环后,完整读取核酸序列。

    技术优势


    更高的通量、更长的读长、更快的速度

    HiSeq 4000系统带来了最高的单日测序通量和每个样品的最低价格,适用于广泛的应用,也成为开展各种基因组应用的高通量实验室的理想选择。HiSeq 4000系统能够在3天内测序12个基因组、100个转录组,或180个外显子组。这种无可匹敌的能力意味着更多样品以更高的深度同时并行测序,产生更加丰富、更有意义的数据。

    灵活的配置
    双流动槽的HiSeq 4000系统能够平行处理一个或两个流动槽,带来最大的数据输出和最高的单日测序通量,其每次运行能够产生1.5 Tb (terabases)和50亿条序列。

    成熟的Illumina技术
    HiSeq 4000系统利用了Illumina所有NGS(新一代测序)系统所使用的可逆终止子边合成边测序(SBS)化学法。SBS提供了卓越的数据质量,是行业中采用最广泛的测序方法。凭借在HiSeq X Ten系统中首次使用的图案式流动槽创新技术,系统带来了非凡的测序通量。

    直观的生物信息学
    HiSeq 4000系统与云端的BaseSpace基因组学计算环境相整合,能提供简单、可扩展的数据分析和存储。



    应用方向

    外显子组测序技术服务

    转录组测序技术服务

    全基因组重测序技术服务

    靶基因捕获测序技术服务

    全基因组甲基化测序技术服务

    RNA m6A甲基化测序技术服务

    16S/18S/ITS扩增子测序技术服务

    宏基因组测序技术服务

    MultiPCR SNP技术服务

  • RT-qPCR技术的黄金斗士

    ABI Prism 7900HT型荧光定量PCR仪是继7700、5700型荧光定量PCR仪之后,推出的更高通量实时荧光定量PCR系统。它是唯一兼容96孔板和384孔板的荧光定量PCR仪。可满足从中通量到高通量实验的需求。一如既往的高性能品质,保障最终检测结果数据的高精准。
    博淼生物拥有两台7900系统,提供不同转录本的定量检测及SNP分型技术服务,沉淀丰富的引物设计经验,保证更高成功率,通量灵活,速度飞快,成为博淼面向科研及临床基因检测重要的技术平台之一。

    技术原理

    绝对定量:为了测定未知样品中的目标(基因)的数量,7900HT系统可用来测定样品的CT,然后用一条标准曲线来测定起始的拷贝数。在标准曲线的绘制中,7900HT系统软件首先用已知的起始拷贝数的几种稀释度计算它们的CT值。接着,软件使用测得的CT值对应于起始拷贝数的对数值作图。至少在五个数量级范围中两者呈线性关系。
    相对定量:对于基因表达研究来说,相对定量是理想的方法。这里不是应用标准曲线而是相对于标定样品计算表达水平。用一个内源对照来标定样品的量。这一方法与7900HT系统在一个多重反应中能同时对目标和内源对照进行定量测定的能力相结合,可实现高效、高通量的基因表达研究。
    有效的SNP检测手段:除实时定量测定以外,7900HT系统包括对于已知的单一核苷酸多态性(SNPS)作大规模筛选的软件。在一对等位基因系统中,用对应于两个等位基因的两个TaqMan探针在同一个试管中做多重PCR反应。反应终止时所产生的荧光用7900HT系统进行测定,实验结果通过分析软件迅速取得。

    技术优势

    ●高效平台-7900HT系统是为支持高通量而构建的, 光学系统经优化以适用于384孔板荧光信号的激活和实时检测。
    ●结果可靠-7900HT系统采用了与7700、5700相同的定量原理,利用Ct值(Ct定义为在基线上方产生可检测到的统计学上显著的荧光发射的这一PCR循环)和起始拷贝数的对应关系,通过外标准曲线精确计算未知样品的起始拷贝数。
    ●高度重现性-7900HT系统的荧光检测发生在PCR对数期的起始,因此反应管中各组分没有任何限制反应因素,从而确保检测结果都是精确并能重复的。
    ●先进的荧光检测技术-RISM® 7900HT荧光定量PCR系统在不降低速度、分辨率的情况下有效提高了产率,这是基于先进的荧光检测技术:一束激光扫描并激活384个孔的每一个孔里的荧光染料,荧光信号通过光栅分光,经过分离的多色荧光同时到达CCD摄像机,实现多色荧光同时检测。
    ●多样的化学试剂-7900HT型荧光定量PCR仪上可使用的化学试剂包括TaqMan荧光探针法和SYBR Green荧光染料法。TaqMan探针法具有高度的灵敏度和特异性,适用于实时定量的多重反应或单核苷酸多态性分析(SNP)。SYBRGreen染料应用于目标鉴定(筛选测定)或者在只需用少数几个反应的测定中最为理想。
    ●有效防污染-7900HT系统在PCR全过程中使用专门设计的和始终密闭的样品管。在加入样品和试剂后这些管子便立即封闭并在扩增和检测过程中保持这种状态,这样就可以大大地减少污染的机会;此外,7900HT系统不存在PCR后处理,有效防止扩增产物对实验环境的污染而造成的假阳性。
    ●多种定量方法-ABIPRISM® 7900HT序列检测系统软件为基因表达提供一种定量化方法。绝对定量是从一个标准曲线上直接测定目标(基因)的量。相对定量方法是通过与标定样品相比较而计算未知样品的量,不需要标准曲线。

    应用方向

    Taqman SNP技术服务

    KASP SNP技术服务

    靶向mRNA定量技术服务

    靶向miRNA定量技术服务

    靶向LncRNA定量技术服务

    靶向cirRNA定量技术服务

  • 代谢组学的经典系统

    超高效液相色谱(UHPLC)和Q Exactive™ 组合型四极杆 Orbitrap 质谱仪联用系统,具备极宽的线性动态范围,出色的分离和定量性能,极佳的分辨率、准确度和灵敏性。博淼生物基于此系统用于非靶向代谢组学、非靶向脂质组学和代谢流检测,能够提高代谢物鉴定的准确性和检测代谢物范围。
    Q Exactive Orbitrap LCMSMS液质联用仪 高性能台式四极杆—轨道阱LC-MS/MS系统,是首台将四极杆的母离子选择性和高分辨率精确质量(HR/AM)OrbitrapTM 质量分析相结合的

    技术原理

    Q-Exactive在轨道阱前面又串联了一个四极杆,离子在液相色谱分离过来之后,可选择让离子直接进四极杆质量分析器进行筛选,筛选后母离子进入Exactive中进行高分辨研究。这款系统的核心价值之一是:非常适合于未知物的扫描和定量;最大的优势在于:不需要搜集很多的标准品、就可进行方法优化。在质谱分类中,Orbitrap属于FT-MS(傅立叶变换质谱)的一种。

    技术优势

    § HRAM 和全扫描能力可以自始至终捕获所有样品数据,从而实现回顾性数据分析而无需再次扫描样品

    § 分辨率高达 140,000 FWHM,可消除同量异序同分异构化合物的干扰,在分析复杂基质中的样品时,提高结果可靠性

    § 全扫描和全离子碎片(AIF)模式质量准确度均优于1ppm,可以确保可靠的化合物识别

    § 12Hz 的快速扫描和多路扫描技术特别适合 UHPLC 应用

    § 快速极性切换可以获得最多信息

    § AIF 和多重解离技术——源内 CID HCD——可以辅助化合物识别

    § 扩展的质量数范围达到 6,000m/z,可以提高对单电荷小分子和生物分子的检测能力

    § 超过四个数量级的扫描动态范围以及飞克级灵敏度,可以在一次扫描中同时检测痕量级和高丰度化合物

    § 和三重四极杆质谱相当的定量能力不仅可用于定量分析母体化合物和代谢物,而且在识别确定化合物同时提供更高通量

    § 快速 HRAM Orbitrap 技术可以消除干扰,实现高可靠性的代谢物结构识别,并可完成大规模代谢组学和脂类组学样品分析

    § MS MS/MS 模式中均可进行现快速扫描到扫描极性切换,可以在单次进样中完成最多的代谢物检测和识别

    应用方向

    非靶向代谢组研究

    非靶向脂质组研究

    代谢流研究

  • UHPLC- TSQ QuantivaTM 三重四极杆质谱仪系统

    超高效液相色谱(UHPLC)和TSQ QuantivaTM 三重四极杆质谱仪联用系统,具备极佳的分离和定量性能,极佳的检出限和定量下限,阿克级灵敏度。博淼生物基于此系统用于靶向代谢组学和部分代谢物代谢流分析,能够对复杂基质能够提供超低水平定量。

    技术原理

    TSQ Quantiva 质谱仪具有极佳的定量性能,阿克级的灵敏度,前所未有的适用性和耐用性。

    · 离子光学系统- 主动离子管控(Active Ion Management, AIM

    · Ion Max NG 离子源

    · 电动离子漏斗技术

    · 带中性离子的离子束传输组件

    · 四极杆设计 -- HyperQuad四极杆

     

    技术优势

    极限的定量性能

    极致的灵敏度

    卓越的稳健性

    应用方向

    靶向代谢组研究

    代谢流研究