单细胞研究服务 - 10×Genomics空间转录组测序
组织中空间原始位置上的基因表达模式对于了解其中细胞群的类型和功能非常重要。尽管近年来空间水平转录组图谱构建技术取得了重要进展,但是由于组织的复杂结构,依然难以实现通过高通量的空间水平转录组图谱鉴定组织的功能。10x Genomics 空间转录组测序技术将高通量且无偏好的总 mRNA 融入到带有形态背景的完整组织切片上,从而确定基因的空间位置信息,探索组织微环境下的基因表达,全面了解组织的形态学背景。该技术的应用可深入揭示细胞群间的相互作用及所处微环境的空间背景,为理解细胞功能及其微环境中位置关系提供了关键信息。并在理解疾病病理学,探索癌症发病机制、神经科学研究等方面有发挥着重要作用。
10x Genomics Visium 空间转录组测序的技术优势包括:
(1)空间分辨率高:每个捕获区域含有约 5000 个被条形码标记的点(Barcoded Spots),每个 Spots 捕获平均 1-10 个细胞;
(2)灵敏度高:每个 Spot 中含有数百万个捕获标签;
(3)项目周期短:一个工作日内可完成从组织切片到文库的工作流程;
(4)数据分析简洁:使用可视化软件注释细胞空间位置信息。
建库测序流程图:
测序文库构建示意图:
生物信息分析流程图: