技术原理
TECHNICAL PRINCIPLE
全基因组甲基化Bisulfite测序(Whole Genome Bisulfite Sequencing,WGBS)是DNA甲基化研究的黄金标准,它通过Bisulfite处理和全基因组DNA测序结合的方式,对整个基因组上的甲基化情况进行分析,具有单碱基的分辨率,可精确评估单个C碱基的甲基化水平,覆盖范围广。它可以构建精细甲基化图谱,建立表观遗传学研究数据库,为后续大规模开展不同样品间的甲基化差异分析提供参考图谱。
全基因组甲基化Bisulfite测序(Whole Genome Bisulfite Sequencing,WGBS)是DNA甲基化研究的黄金标准,它通过Bisulfite处理和全基因组DNA测序结合的方式,对整个基因组上的甲基化情况进行分析,具有单碱基的分辨率,可精确评估单个C碱基的甲基化水平,覆盖范围广。它可以构建精细甲基化图谱,建立表观遗传学研究数据库,为后续大规模开展不同样品间的甲基化差异分析提供参考图谱。
基于全基因组重亚硫酸盐转化的WGBS法,实现单碱基分辨率的甲基化位点精准、高效定位;
完善的流程质控,保障最终的数据质量,如通过标准品DNA 和 H19 等基因位点的多个质控因素,保证Bisulfite 对 DNA 处理的完全性;
相比于EWAS芯片,其位点数量可达550万个以上,分布于不同基因类型(mRNA、miRNA、lncRNA、cirRNA、tRNA),及不同的基因调控区域(promoter、intron、exon、3UTR等等)。
全基因组分析筛选差异CpG site及DMR区域等,及调控基因的功能分析,更侧重汇集全面因素深度筛选最具价值位点及区域,进行二期多中心大群体样本的验证。
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