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修饰蛋白质组研究服务 - O糖基化蛋白质组

 

   O-糖基化,在高尔基体中进行,通常第一个连接上去的糖单元是 N-乙酰半乳糖,连接部位 Ser、Thr,然后逐渐将糖转移上去形成寡糖链,糖链结构无规律。

   


         数据库的选择是以所需物种、数据库注释完备性及序列可靠性为参考依据的。


         在选择数据库时,遵循如下原则,若为已经测序生物,直接选用该物种数据库,若为非测序生物,则选择与被测样品最为相关的大类蛋白质组数据库。本次使用数据库:Uniprot_**********,*****sequence(2020.03.16 Download)数据库。


        采用byonic软件搜库,检索参数设置如下:




                O-糖蛋白质定性结果统计示例:




                 不同糖型的分布示例:




                     糖谱图展示示例: