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10×Genomics单细胞转录组测序

技术原理

TECHNICAL PRINCIPLE

基于10X Genomics Chromium系统微流控凝胶微珠技术,利用油包水的微反应体系,对新鲜细胞悬液样本中的500~10,000个单细胞进行捕获标记,同时对已标记细胞中的mRNA分子进行独立标记,逆转录出cDNA,带有独特的Barcode标签 和UMI标签,再按照illumina建库步骤进行文库构建、 illumina测序仪上机测序、生信分析。

    技术优势

    TECHNOLOGICAL SUPERIORITY

    开启上门技术服务

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    由于对于样本细胞活性、结团率等要求非常高,为了提升实验成功率,博淼生物开启携带10X Genomics Chromium仪器上门单细胞分选等前期实验

    不同组织样本处理条件优化

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    博淼生物联合美天旎公司,除了提供常规商业化组织细胞悬浮液制备试剂盒处理对应组织样本之外,针对其它来源组织,可以专属性的进行条件优化,进而保障最高质量的细胞悬浮液

    平台技术优势

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    10X Genomics引领了单细胞组学研究领域的快速发展。样本处理周期短,从细胞悬液到测序所需cDNA文库的整个流程可在一天内完成;通量高,一次可以同时测8个样本,每个样本至多可测10000个细胞;捕获效率高,最高可达65%捕获率;运用10×官方软件和可视化工具分析细胞聚类及基因表达等。

    Illmuina测序系统的兼容

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    兼容Illumina® HiSeq®4000/2500/NextSeq®/MiSeq® 测序系统

    服务流程

    SERVICE PROCESS

    • 样品准备

      细胞样品
      组织样品

    • 单细胞分选

      形成GEMs
      cDNA逆转录

    • 文库构建

      3’端cDNA文库构建

    • 高通量测序

      小数量测序预实验评估细胞数量
      PE150测序

    • 数据分析

      UMI计数,评估细胞数
      t-SNE降维分析细胞聚类
      差异基因表达分析
      GO/KEGG注释分析等等

    样本要求

    SAMPLE REQUIREMENTS