4006-506-908

靶向Massarray 甲基化定量

技术原理

TECHNICAL PRINCIPLE

MassARRAY EpiTYPER技术结合碱基特异性酶切(分子切割)和MALDI-TOF检测原理,可实现多重CpG sites的定量分析检测,两者的完美结合使得该技术成为高准确性、高通量及高灵敏度的DNA甲基化定量分析手段。碱基特异性酶切(MassCLEAVE)实验由亚硫酸盐处理待测 DNA 开始。经过亚硫酸盐处理,DNA中的未甲基化的胞嘧啶 (C) 转变为尿嘧啶(U),由此在 DNA 模板中产生甲基化特异的序列变化。利用 5' 末端带有T7-启动子的引物进行 PCR 扩增,产物经 SAP (虾碱性磷酸酶)处理后用于碱基特异性的酶切反应。酶切后 DNA 片段的大小和分子量取决于亚硫酸盐处理后的碱基变化,飞行质谱能测出每个片段的分子量,配套软件 EpiTYPER 则能自动报告每个相应片段的甲基化程度。

    技术优势

    TECHNOLOGICAL SUPERIORITY

    国内最大的massarray 靶向DNA甲基化定量分型科研服务商

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    DNA甲基化的定量检测由于片段均为高GC含量片段,属于基因检测项目中成功率较低的研究领域,故众多同行避而远之,博淼生物扎实优化、沉淀经验,成熟的技术流程及替代方案等,均可高质量的保障检测效率,赫然稳居massarray DNA甲基化定量检测服务领域的前列,年度两万份例次以上的样本检测量和众多高质量的SCI文章是最好的见证。

    前沿的靶向DNA甲基化方案设计服务

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    针对EWAS筛选的CpG sites验证方案设计,博淼生物具有完善的优化分析方案,全面进行深度设计;针对靶向基因的区域进行方案设计,博淼生物拥有经典的设计流程。免费、详实的方案设计思路,保证整体DNA表观研究的先进性及完整性,淼倡导的“我们提供的不仅仅是检测……”理念最好的践行。

    创新的多组学设计理念

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    伴随系统生物学的日益成熟,围绕DNA甲基化的遗传调控机制研究方案不断扩展,传统的DNA甲基化与RNA转录表达方案设计、SNP与靶向区域中DNA甲基化的cis-mQTL方案设计、DNA甲基化与通路靶向代谢物的方案设计均成为了博淼生物的代表性服务内容。

    Massarray技术优势

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    该技术是目前靶向DNA甲基化定量检测一次性覆盖片段最长的技术,可达400-600bp;精度高,检测低至5%的甲基化水平;无需设计CpG位点特异性引物,无需进行PCR产物纯化,研究几个到几百个甲基化位点的理想手段;通量高,采用384个样本反应模块。每年度全球几千篇的SCI文章,足以说明massarray技术DNA定量甲基化的金标准。

    临床医学基因检测项目开发商

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    目前DNA甲基化定量成为临床医学中疾病早期诊断的重要标记物,尤其在肿瘤的早期诊断中有巨大的应用前景,坚信随着全基因组表观遗传学及大型队列样本的深入研究,未来基于特定DNA甲基化位点作为标记物在临床中的广泛应用,博淼生物期待与科研团队及同行合作,基于massarray技术共同开发具有临床应用价值的转化项目。

    服务流程

    SERVICE PROCESS

    • 靶向DNA CpG site筛选

      客户提供靶向序列及位点;
      博淼生物设计方案

    • 引物设计

      EpiDesigner引物设计

    • 样本提供及质检

      全血、组织等DNA提取;
      DNA质检

    • 预实验评估

      PCR扩增预实验评估;
      替补方案备选;

    • Massarray质谱检测

      384反应模块

    • 生物信息学分析

      T检验分析;
      逻辑回归分析;
      线性回归分析;
      DMR分析等等

    样本要求

    SAMPLE REQUIREMENTS