4006-506-908

10×Genomics单细胞ATAC-Seq

技术原理

TECHNICAL PRINCIPLE

10x单细胞ATAC-seq基于GemCode微流体平台,首先利用转座酶混合液孵育细胞核悬液,转座酶进入细胞核,优先在切割开放染色质区域使DNA片段化,并在DNA片段的末端添加测序引物;其次,带有标签(Barcode)的凝胶珠(GelBeads)和单个细胞核包裹在油滴中,形成GEMs;随后凝胶珠溶解,细胞核裂解释放DNA片段,并在片段末端加上标签;GEMs破裂后,回收带有标签的DNA,构建文库;最后,利用Illumina测序平台对文库进行高通量测序。

    技术优势

    TECHNOLOGICAL SUPERIORITY

    开启上门技术服务

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    由于对于样本细胞活性、结团率等要求非常高,为了提升实验成功率,博淼生物开启携带10X Genomics Chromium仪器上门单细胞分选等前期实验

    不同组织样本处理条件优化

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    博淼生物联合美天旎公司,除了提供常规商业化组织细胞悬浮液制备试剂盒处理对应组织样本之外,针对其它来源组织,可以专属性的进行条件优化,进而保障最高质量的细胞悬浮液。

    平台技术优势

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    线粒体DNA的reads数<2%;Tn5转座酶切割染色质的开放区域,同时在未知**段的末端添加测序引物,省时省力;通量高,一次可以同时测8个样本,每个样本至多可测>10000个细胞;获得染色质所有开放染色质区域,不局限于某个转录因子位点或蛋白保护区域;运用10×官方软件和可视化工具分析单细胞表观遗传数据等。

    Illmuina测序系统的兼容

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    兼容Illumina® HiSeq®4000/2500/NextSeq®/MiSeq® 测序系统。

    服务流程

    SERVICE PROCESS

    • 细胞裂解

      单细胞核悬浮液制备

    • Tn5转座酶处理

    • 文库制备

    • 上机测序

      PE150测序

    • 数据分析

      测序深度统计、 差异Peak分析、 GO富集分析、 差异基因分析等

    样本要求

    SAMPLE REQUIREMENTS