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多组学整合方案研究服务 - Bulk多组学&单细胞转录组联合研究

 

   Bulk omics&Single cell omics研究策略概述:




   WES&ScRNA-seq联合研究示例:






   (1)在自闭症谱系障碍(ASD)的研究中,分析了35,584本的全显子据,共别 出102个与ASD相关的高风险基因。

   (2)单细胞测序结果表明,这102个基因主要在成的抑和兴奋经元中表达。

   (3)本研究更深入了解了自闭症高风险基因的子机制也有于发现疗和减自闭症某些严重症状的方法。

 

   GWAS&ScRNA-seq联合研究示例:





   (1)本研究用GWAS分析鉴定出244个PIBD风险相关的基因,在上皮效应细胞和干或祖细胞亚型中叠加候选PIBD风险基因,例如,ERN1与CD和UC风险相关,并介导未折叠蛋白反应,在干细胞、祖细胞和肠内分泌细胞中高度表达;CASP7,一种细胞消亡蛋白酶,介导感染诱导的上皮细胞死亡,在结肠细胞( colonocytes )和colonocytes-BEST4 细胞中表达。


   (2)PIBD风险基因的差异表达可能导致上皮完整性受损和应激反应。

Microbiomics&ScRNA-seq联合研究示例:









         1)运用单细胞转录组和蛋白质谱分析量化了30种细胞类型的细胞活性状态变化,通过整合分析,预测了调节性蛋白的细胞来源,衰老小鼠中2型肺泡壁细胞和脂肪成纤维细胞中的胆固醇合成增加;

        (2)创建了公开的肺衰老细胞参考图谱;

        (3)揭示了肺部老化的几大标志:2型肺泡壁细胞和脂肪成纤维细胞胆固醇合成的增加,以及呼吸道上皮细胞的改变。