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代谢组与GWAS整合研究

技术原理

TECHNICAL PRINCIPLE

全基因组关联分析(Genome-Wide Association Study,GWAS)已经识别了大量相关的基因组变异位点,并在实践中发现了许多关联基因,但却仅能解释遗传性的一小部分。而高通量、高灵敏的大规模代谢组学研究方法的建立使代谢组数据和全基因组联合分析(Metabolome Genome Wide Association Study, mGWAS)成为可能。mGWAS能够应用在高遗传效应的基因定位以及基因功能研究中,为疾病机理研究提供新思路。mGWAS目前已用于多种疾病(如癌症、肥胖、心血管疾病、糖尿病、抑郁症和阿尔兹海默症)及动植物遗传(如番茄、棉花、玉米)的遗传机制研究。

    技术优势

    TECHNOLOGICAL SUPERIORITY

    双品牌服务护航

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    博淼生物核心的服务品牌GWAS技术,及近年来着力打造的代谢组服务品牌,双品牌服务的丰富技术经验,从而保证mGWAS的方案设计、技术检测、数据分析等的全面性、前沿性。

    更全面的GWAS芯片

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    在人源GWAS芯片拥有适用中国人群的经典中华芯片,及最新的东亚人群ASA芯片,还有更高密度的2.5M等系列商业化芯片,此外在动植物方面,拥有illumina公司系列商业化芯片,经典的检测技术、广泛的科研应用,保证mGWAS中全基因组基因分型数据的准确性。

    更全面的代谢组技术

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    博淼生物拥有不同面向代谢组检测范围的技术,覆盖非靶向代谢组(最高可达1000种代谢物)、脂质类代谢组、及更多类型的靶向代谢组,满足更多科研项目的设计需求。

    mGWAS的方案优势

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    mGWAS研究中以代谢物为数量性状,进行代谢物与基因组变异位点的关联分析,鉴于检测到的代谢物数量多(300-1000种代谢物)、差异大(10-10000倍)、遗传效应高(解释超过40%变异),得到的结果优于传统表型性状。

    服务流程

    SERVICE PROCESS

    • 样本准备

      GWAS样本—DNA、外周血等
      代谢组样本—粪便、血清等

    • 技术检测

      GWAS技术—中华芯片、ASA芯片等
      代谢组技术—LC MS/MS技术

    • 生物信息学分析

      mQTL分析
      基因功能分析等等

    样本要求

    SAMPLE REQUIREMENTS