4006-506-908

16S/18S全长扩增子测序

技术原理

TECHNICAL PRINCIPLE

PanBio系统采用的为单分子实时测序系统(SMRT),应用了边合成边测序的原理,以SMRT芯片为测序载体。基本原理为:聚合酶捕获文库DNA序列,锚定在零模波导孔底部;4种不同荧光标记的dNTP随机进入零模波导孔底部;荧光dNTP被激光照射,发出荧光,检测荧光;荧光dNTP与DNA模板的碱基匹配,在酶的作用下合成一个碱基;统计荧光信号存在时间长短,区分匹配碱基与游离碱基,获得DNA序列;酶反应过程中,一方面使链延伸,另一方面使dNTP上的荧光基因脱落;聚合反应持续进行,测序同时持续进行。

    技术优势

    TECHNOLOGICAL SUPERIORITY

    超长读长

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    平均读长8-12kb,可以一次性获取全长的16S/18S ,更高准确的进行菌”种”鉴定

    准确率高

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    对于基因组变异检测,可以最多达到99.9999%的准确率

    丰富的项目经验

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    针对不同样本来源具有丰富的核酸提取经验,包括粪便、土壤、口腔等等,从而保障后续建库及测序的成功率

    前沿的多组学交互方案设计经验

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    聚焦于微生物基因组与代谢组的整合方案设计,尤其是粪便样本类型的宏基因组与代谢组的调控机制分析,深度挖掘特定菌群的基因在人体代谢通路中的功能意义。

    服务流程

    SERVICE PROCESS

    • 样本DNA提取及质控

      粪便;
      血液;
      土壤;
      DNA等

    • 16S/18S全长PCR扩增

      产物纯化;
      定量

    • 文库制备及质控

      >2kb文库长度

    • 三代测序

      PacBio Sequel测序;
      数据量>5000 CCS reads

    • 生物信息学分析

      数据质控;
      OTU聚类及过滤;
      物种差异分析等等

    样本要求

    SAMPLE REQUIREMENTS