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RNA m6A甲基化测序

技术原理

TECHNICAL PRINCIPLE

MeRIP-Seq可以通过NGS技术对于全转录组进行m6A的定性检测,可以高通量的检测覆盖mRNA、miRNA、LncRNA、cirRNA的m6A异常区域,分辨率为100nt左右。其技术核心为将m6A抗体与带有m6A的mRNA片段相结合后进行高通量测序。分别将构建好的2个测序文库,即m6A-seqlibrary和RNA-seqlibrary分别进行高通量测序。对下机数据进行生物信息学分析,对发生m6A甲基化程度较高的区域进行peakcalling。由于不能做到单个碱基的分辨率,所以只能对大致的区域进行分析。通过与常规的转录组测序结果相比,从而分析存在非常明显的高甲基化峰。

    技术优势

    TECHNOLOGICAL SUPERIORITY

    成熟的检测技术

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    m6A-seq的技术核心在于前期样本的IP富集效率,博淼生物采用预验证的商业化抗体,结合丰富的项目检测经验积累的实验流程,保障了高的富集效率和m6A特异性,并通过严格的质控,最终获取优质的测序数据。

    全转录本的m6A检测

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    博淼不仅提供mRNA转录本的m6A检测,同时提供针对total RNA的m6A检测,类型涉及更为全面的miRNA、lncRNA、cirRNA转录本。

    专业的生物信息学分析

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    博淼生物可提供围绕m6A peak差异分析等基本数据处理内容,同时结合RNA转录测序数据进行整合分析,挖掘m6A的相关功能意义。

    服务流程

    SERVICE PROCESS

    • 样本提供

      细胞
      组织
      外周血
      RNA样品等

    • 文库构建

      MeRIP-seq建库
      RNA-seq建库

    • NGS测序

      Hiseq4000系统

    • 生物信息学分析

      Peak calling
      差异Peak分析
      Motif分析等

    样本要求

    SAMPLE REQUIREMENTS