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转录组测序服务

发布时间:2019-05-09 分享到:

mRNA是由DNA的一条链作为模板转录而来的、携带遗传信息的能指导蛋白质合成的一类单链核糖核酸。普通转录组测序服务,采用Illumina 高通量测序平台,对真核生物的特定细胞或组织在某一状态下所能转录出来的所有mRNA进行测序,与参考基因组比对,可全面快速针对mRNA序列和丰度信息、并对基因结构和产生的低丰度新转录本等进行分析,成为RNA-seq中最为基础的检测方向。

博淼生物基于RNA“承上启下”的功能机理,联合其他组学的技术服务项目,不断扩展系统生物学的遗传调控机制研究整体服务。


技术原理

普通转录组测序,通过mRNA富集、片段化、反转录、加接头、PCR扩增、长度选择等方法,获取带有接头序列Barcode序列cDNA文库。文库构建完成后,就可以把不同样品的文库混合,并上机测序,从而获得需要的mRNA数据信息。



技术优势  

1 全面的整合方案设计:博淼生物围绕转录组,整合基因组、表观基因组、代谢组的整体解决方案,既包括传统的表观基因组与转录组的联合,经典的全外显子组和转录组的联合,还包括热点的GWAS+EWAS+RNA-seq的联合及转录组与代谢组的联合,均可以在组学层面形成系统生物学的遗传调控分析。

2 前沿技术的融合:伴随博淼生物的单细胞转录组测序技术的不断升级,将基于bulk的混合细胞的转录组测序与单个细胞测序转录组的技术融合,并数据整合分析,可以深度挖掘特异细胞类型的基因变化及功能机制等,已成为该领域中前沿的技术解决方案。

3 技术流程的更优化:博淼生物采用自动化转录组建库平台,可以更快速、高通量的完成建库,结合Illumina 测序平台,保障最终高质量的数据。

4 定制化的数据分析:mRNA-seq数据分析已然成为标准化的分析流程,包括基因表达定量、剪切体鉴定、融合基因、cSNP分析等,对于多组学的整合分析,博淼会根据不同的项目需求提供定制化的数据分析服务。


服务流程  

1. 样本提取

组织、细胞

Total RNA

全血等

2. 样本质控

3. 文库构建

4. NGS测序

PE150

6G~12G data

5. 信息分析

数据质控

基因表达定量

转录本结构及cSNP变异等等

 

样本要求


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