LncRNA转录组测序服务
发布时间：2019-05-09 分享到：
长链非编码RNA（long noncoding RNA, lncRNA）,是一类长度超过200 nt的长链非编码RNA，其功能是通过与DNA、RNA或蛋白质结合，在表观遗传、转录及转录后等水平调控基因表达。LncRNA 在剂量补偿效应、表观遗传调控、细胞周期调控和细胞分化调控等众多生命活动中发挥重要作用，也与包括癌症在内的多种疾病息息相关，也正因此成为生命科学领域的研究热点。本服务采用Illumina平台进行测序，针对有参考基因组样本开展准确的lncRNA鉴定和lncRNA靶基因预测，同时提供针对测序数据中mRNA的分析，结果更全面，广泛应用于医学、农学研究领域。
此外，博淼生物针对lncRNA转录组测序分析重要的功能差异lncRNA，可以结合LncRNA相关SNP或者启动调控区域的DNA甲基化进行延伸方案设计，进一步讨论基因变异对于lncRNA转录的调控影响，该方案路线成为博淼生物特色服务内容之一。
技术原理
lncRNAs测序，采用去除rRNA的方法富集长链RNA，并使用链特异性建库方式进行文库构建，然后使用Illumina 测序平台进行测序，从而同时获得LncRNA和mRNA的数据信息。
技术优势
1 拓展性RNA-seq方案设计：博淼生物提供LncRNA-seq分析之后的特色拓展性方案设计，针对差异显著、功能意义显著的lncRNA，针对其不同区域的SNP研究，或者调控区域的DNA甲基化研究，从而研究其基因变异的转录调控机制，由博淼生物提供的该路线方案检测服务数据，发表在Gastroenterology杂志，并成为当期的封面推荐文章，具有重要的意义。
2 ceRNA的调控分析：与miRNA-seq的数据整合分析，可以深入预测lncRNA-miRNA-mRNA的ceRNA调控网络分析，深度探讨lncRNA的分子功能机制，成为lncRNA领域研究的重要方向。
3全面的lncRNA数据分析：博淼生物提供全面的lncRNA数据分析，内容包括：LncRNA表达水平差异分析、novel LncRNA鉴定、调控靶基因预测分析、靶基因差异分析等等。
服务流程
1. 样本提取
组织、细胞
Total RNA
全血等等
2. 样本质控
3. 文库构建
4. NGS测序
PE150测序
10G~20G data
5. 信息分析
数据质控
LncRNA差异分析
LncRNA靶基因预测等等
样本要求
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