LncRNA实时定量PCR技术
发布时间:2019-05-09 分享到:
lncRNA ( Long noncoding RNA,长链非编码 RNA ) 是一类长度超过 200 个碱基的长链非编码 RNA 分子,可在多种层面调控基因的表达。它们本身并不编码蛋白,而是以 RNA 的形式调控基因的表达。近年来研究表明,lncRNA 参与 X 染色体沉默,基因组印记以及染色质修饰,转录激活,转录干扰,核内运输等多种重要的调控过程,其调控作用开始引起人们广泛关注。
服务流程:
1. 引物设计、合成及测试
a. 从权威数据库(Refseq, UCSC known gene, ensemble, 相关文献)中得到非编码RNA的序列,屏蔽SNP及重复序列。
b. 在引物设计软件中,调整引物的设计位点,将引物设计在转录本特异的区域,如: exon-exon的连接点附近。然后根据PCR的反应条件,优化引物参数,如 Tm值,产物大小,二级结构,引物二聚体等。
c. 通过和数据库blast比对,降低引物非特异性扩展的可能性。
d. 通过实验对引物的扩增效果进行测试。
2. 样品RNA抽提及RNA质量检测
a. 紫外吸收测定法测定RNA在波长260nm和280nm的吸收值,获得RNA的浓度并通过 A260/280及A260/230的吸收比值判断RNA的纯度。
b. 甲醛变性琼脂糖凝胶电泳检测RNA纯度和完整性。
3. 逆转录合成cDNA
利用链特异性的反转录引物进行RT反应,合成cDNA。
4. 实时定量PCR
以合成的cDNA作为模板进行实时定量PCR扩增。同时检测每个样品中内参基因的表达量,校正上样误差。
5. 分析结果、提供实验报告
分析实时定量PCR结果,提供实验报告,包括详细的实验方法,实时定量PCR实验数据和图表。
技术优势:
· 最先进的设计软件,确保探针及引物设计的特异性
· 探针法或染料法定量分析,一切以客户需求为导向
· 探针合成委托国内最好的合成公司,确保探针质量
· 染料法采用2 -ΔΔc(t) 法,操作简便,节约时间
· 正式实验前先进行预实验,慎重对待客户的委托
· 报告详尽,数据可靠,结果真实,实验科学
样本要求:
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